Úkryt Teamu Magma je operační základna. V závislosti na hrané hře se základna nachází v jedné ze dvou lokalit.

V seriále
V epizodě „Gaining Groudon“ byla základna ukázána jako velká mořská pevnost. Ash a jeho kamarádi byli uneseni a vězněni. Tam ale utekli ve zmatku, když Kyogre unikl za pomocí Teamu Aqua. Team Magma evakuoval bezpečně jejich úkryt, ale ten se kvůli obrovské díře způsobené Kyogreovým Hyperpaprskem potopil.

Ve hře Ruby
Úkryt je umístěn na stejném místě jako Úkryt Team Aqua a má stejné rysy. Je umístěna na východ od města Lilycove. Tato oblast je přístupná tehdy, až team Magma ukradne ponorku z města Slateport. Na vnitřní straně najde hráč teleport. V úkrytu je určitý počet vojáků včetně admina Tabithy, který říká, že vůdce teamu Magma odešel s ponorkou do hlubin blízko města Sootopolis. Po zakončení všech úkolů má hráč přístup na Stezku 124, která byla zablokovaná vojáky, kteří cvličili Wailmera.

Ve hře Sapphire
Ve hře Sapphire není tento úkryt přítomen. Team Magma napomáhá hráči porazit team Aqua.

Ve hře Emerald
Ve hře Emerald se základna nachází v hoře Chimney. Hráči je přístupna tehdy, když vlastní předmět Magma Emblem. To je to místo, kde se po porážce Maxieho probouzí Groudon silou Blue Orbu.